Figlia di Filippo II di Borgogna e di Margherita III delle Fiandre, nacque a Digione nel 1386.
Nel 1401 sposò Amedeo VIII conte di SavoiaThonon-les-Bains
il quale ottenne nel 1416 dall'imperatore Sigismondo l'elevazione della contea a ducato.
Dei nove figli di Maria e Amedeo VIII raggiunsero l'età adulta Maria di Savoia, Amedeo, Ludovico, Filippo e Margherita di Savoia.
Maria morì a Thonon-les-Bains nel 1422.