Nata a Firenze il 20 dicembre 1902 e laureatasi a Bologna nel 1924, Margherita Guarducci approfondì gli studi di archeologia a Roma e a Atene.
Fu antichista, archeologa, professoressa di epigrafia a Roma, socio nazionale dei Lincei.
Scrisse un ampio trattato di Epigrafia Greca e fu autrice della raccolta delle Inscriptiones Creticae. Compose diversi saggi sugli scavi sotto la Basilica di San Pietro.
Nel 1980 espresse parere negativo sull'autenticità della Fibula Prenestina.
Morì a Roma il 2 settembre 1999.