Nato intorno al 380 ad Auxerre da nobile famiglia, Germano visse a Roma sotto Onorio per studiare diritto ed iniziò una la carriera come funzionario statale. Fu prefetto di Auxerre, città della quale divenne vescovo nel 418 in seguito ad eventi non noti.
Dal 429 al 431 guidò insieme a Lupo di Troyes una missione in Bretagna per combattere il pelagianesimo, nel 447 e 448 ripetè la spedizione insieme a Severo di Treviti. Queste missioni ebbero risultati importanti: il pelagianesimo fu quasi eliminato a tutto vantaggio del cristianesimo e del monachesimo.
In seguito Germano ebbe presso di se a Auxerre Patrizio, l'apostolo dell'Irlanda, e lo consacrò vescovo.
Nel 448 si recò a Ravenna in visita a Valentiniano III e vi morì il 31 luglio.