Figlia del re dei Burgundi Chilperico, nacque a Lione nel 474.
Sposò il re dei Franchi Clodoveo I dal quale ebbe tre figli: Clodomiro, Childeberto I e Clotario I.
Cattolica, convinse il marito a convertirsi alla sua religione e Clodoveo si fece battezzare insieme a gran parte dei suoi soldati iniziando un processo che portò rapidamente alla conversione di tutti i Franchi.
Quando Clodoveo morì (511) Clotilde si ritirò nel monastero di San Martino di Tours, mentre fra i figli si aprivano dure lotte per la successione.
Clotilde morì il 3 giugno 545, venne sepolta a Parigi ed immediatamente proclamata santa.
La Chiesa la ricorda il 3 giugno.