Il Museo Civico Medievale di Bologna ha sede nel Palazzo Fava Ghisilardi, in Via Manzoni n. 4.
Il palazzo fu iniziato nel 1483 ed incorporò la preesistente Torre dei Conoscenti.
Nato dallo scorporo della sezione medievale del Museo Civico Archeologico, il Museo Medievale comprende opere provenienti dalle collezioni del Marchese Cospi e del pittore bolognese Pelagio Palagi, donata quest'ultima al comune di Bologna nel 1861.

Importanti elementi del patrimonio del museo sono:

- le raccolte naturalistiche ed etniche con monufatti ed oggetti d'arte di numerose culture europee, orientali e dell'America precolombiana
- il lapidario
- le arche funebri dei dottori dello Studio Bolognese
- la statua in rame di Bonifacio VIII opera dell'orafo Manno di Bandino da Siena
- collezione di sculture bolognesi dal XIV al XVI secolo
- sepolcro del giurista Lorenzo dal Piano, opera di Paolo di Bonaiuto
- Raccolta di armi antiche
- Collezione di avori gotici, rinascimentali e barocchi.

Fra le opere d'arte custodite nel museo:

- Sepolcro del giurista Lorenzo del Pino di Paolo di Bonaiuto
- Madonna col Bambino e Santi di Jacopo della Quercia
- Tomba di Bernardino Zambeccari di Andrea da Fiesole
- San Michele Arcangelo, gruppo bronzeo di Alessandro Algardi
- Busto di Gregorio XIII di Alessandro Menganti
- Busto di Gregorio XV di Gian Lorenzo Bernini
- Marzia legato all'albero, bronzo di Andrea Briosco detto il Riccio
- Lastra tombale di Domenico Garganelli di Francesco del Cossa
- Cristo in Pietà di Francesco Francia
- Presepe di Andrea da Fiesole
- San Bernardino sul letto di morte di Antonio Federighi
- Lastra tombale di Pietro Canonici di Vincenzo Onofri
- Bozzetti per la fontana del Nettuno di Giambologna
- Storie di Giasone affreschi di Ludovico, Annibale e Agostino Carracci